Несмотря на то, что первая новостроечная археологическая экспедиция была организована в СССР еще в 1929 г. и большие новостроечные работы проводились в зонах затопления водохранилищ на Дону и Волге в сер. 50-х гг., сектор новостроечных и хоздоговорных экспедиций как самостоятельное подразделение Института археологии РАН был организован только в 1972 г.

С 1984 по 1987 г. Сектор совместно с сектором археологических сводов входил в отдел археологической службы, возглавлявшейся В.В. Седовым. В 1987 г. сектор был преобразован в отдел охранных раскопок. В разные годы сектор, а затем отдел возглавляли И.И. Артеменко, Ю.А. Краснов, С.А. Беляев, Г.Е. Афанасьев, А.С. Смирнов. Сегодня его возглавляет А.В. Энговатова.

За более чем 20 лет работы сотрудниками отдела были проведены десятки экспедиций на новостройках нашей страны. Наиболее масштабными они были в 1970-1980-е гг. в связи с большими мелиоративными работами на юге страны, где работали Донская, Северо-Кавказская, Ставропольская, Поволжская и Фанагорийская экспедиции.

Начиная с 1990 г., основные работы отдела были сосредоточены, в основном, на строительстве новых автодорог и ниток газопроводов, проходящих по северным и центральным областям России.

В своей научной работе сотрудники отдела постоянно используют компьютерные методы обработки материала, создают базы и банки данных. Отдел активно участвует в организации выставок археологических находок, полученных в результате работ экспедиций Института. Определенным итогом научной деятельности отдела являются девять монографий и более 160 статей, изданных в России и за рубежом.

Важной вехой деятельности Отдела охранных раскопок является ежегодное проведение научного семинара "Археология Подмосковья".

Заседания отдела проводятся по понедельникам по адресу: Метро “Академическая”, ул. Дм.Ульянова, 19, каб 31. Начало в 12 часов.